Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trub2Q91WG3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms