Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmcd1Q8VEE1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmcd1Q8VEE1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms