Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms