Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Krt25Q8VCW2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt25Q8VCW2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms