Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4I1

Atxn7, Ataxin-7, mousemouse

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7Q8R4I1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atxn7Q8R4I1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atxn7Q8R4I1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atxn7Q8R4I1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atxn7Q8R4I1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atxn7Q8R4I1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Atxn7Q8R4I1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atxn7Q8R4I1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn7Q8R4I1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn7Q8R4I1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn7Q8R4I1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn7Q8R4I1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn7Q8R4I1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn7Q8R4I1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn7Q8R4I1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn7Q8R4I1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn7Q8R4I1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn7Q8R4I1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn7Q8R4I1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn7Q8R4I1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn7Q8R4I1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn7Q8R4I1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms