Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc12Q8R344 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms