Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rnf183Q8QZS5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf183Q8QZS5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf183Q8QZS5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rnf183Q8QZS5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rnf183Q8QZS5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rnf183Q8QZS5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rnf183Q8QZS5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Rnf183Q8QZS5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Rnf183Q8QZS5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Rnf183Q8QZS5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Rnf183Q8QZS5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf183Q8QZS5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Rnf183Q8QZS5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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