Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hecw1Q8K4P8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Hecw1Q8K4P8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Hecw1Q8K4P8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms