Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
OptnQ8K3K8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OptnQ8K3K8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms