Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MyripQ8K3I4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms