Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3A2

Trpt1, tRNA 2'-phosphotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpt1Q8K3A2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpt1Q8K3A2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpt1Q8K3A2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpt1Q8K3A2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpt1Q8K3A2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpt1Q8K3A2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpt1Q8K3A2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpt1Q8K3A2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpt1Q8K3A2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms