Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fbxo18Q8K2I9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms