Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otud6bQ8K2H2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud6bQ8K2H2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms