Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcf3Q8K268 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcf3Q8K268 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms