Protein–RNA interactions for Protein: Q8K262

Plac9, Placenta-specific protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac9Q8K262 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Plac9Q8K262 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plac9Q8K262 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms