Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syne4Q8CII8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syne4Q8CII8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms