Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tshz3Q8CGV9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tshz3Q8CGV9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tshz3Q8CGV9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tshz3Q8CGV9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tshz3Q8CGV9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms