Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rp1l1Q8CGM2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rp1l1Q8CGM2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rp1l1Q8CGM2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rp1l1Q8CGM2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rp1l1Q8CGM2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rp1l1Q8CGM2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rp1l1Q8CGM2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rp1l1Q8CGM2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rp1l1Q8CGM2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rp1l1Q8CGM2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rp1l1Q8CGM2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rp1l1Q8CGM2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rp1l1Q8CGM2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rp1l1Q8CGM2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rp1l1Q8CGM2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rp1l1Q8CGM2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rp1l1Q8CGM2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rp1l1Q8CGM2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rp1l1Q8CGM2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rp1l1Q8CGM2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rp1l1Q8CGM2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rp1l1Q8CGM2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rp1l1Q8CGM2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rp1l1Q8CGM2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rp1l1Q8CGM2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rp1l1Q8CGM2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rp1l1Q8CGM2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rp1l1Q8CGM2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rp1l1Q8CGM2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rp1l1Q8CGM2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rp1l1Q8CGM2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rp1l1Q8CGM2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rp1l1Q8CGM2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rp1l1Q8CGM2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rp1l1Q8CGM2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rp1l1Q8CGM2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rp1l1Q8CGM2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms