Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms