Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc73Q8CDM4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms