Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB65

Nemp2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp2Q8CB65 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nemp2Q8CB65 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nemp2Q8CB65 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nemp2Q8CB65 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nemp2Q8CB65 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nemp2Q8CB65 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nemp2Q8CB65 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms