Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Spef2Q8C9J3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Spef2Q8C9J3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms