Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tsr2Q8C8T8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tsr2Q8C8T8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms