Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4930504O13RikQ8C5Z9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930504O13RikQ8C5Z9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930504O13RikQ8C5Z9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms