Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3M9

Uncharacterized protein C2orf80 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C3M9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C3M9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C3M9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C3M9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C3M9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C3M9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8C3M9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C3M9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C3M9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C3M9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C3M9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C3M9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C3M9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C3M9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C3M9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C3M9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C3M9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8C3M9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C3M9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C3M9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C3M9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C3M9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C3M9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C3M9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C3M9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C3M9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C3M9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C3M9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C3M9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8C3M9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms