Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms