Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp5Q8BX09 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp5Q8BX09 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms