Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zcchc4Q8BKW4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zcchc4Q8BKW4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zcchc4Q8BKW4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zcchc4Q8BKW4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zcchc4Q8BKW4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zcchc4Q8BKW4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zcchc4Q8BKW4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Zcchc4Q8BKW4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Zcchc4Q8BKW4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zcchc4Q8BKW4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zcchc4Q8BKW4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zcchc4Q8BKW4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zcchc4Q8BKW4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zcchc4Q8BKW4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zcchc4Q8BKW4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zcchc4Q8BKW4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zcchc4Q8BKW4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zcchc4Q8BKW4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zcchc4Q8BKW4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zcchc4Q8BKW4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zcchc4Q8BKW4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zcchc4Q8BKW4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zcchc4Q8BKW4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zcchc4Q8BKW4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zcchc4Q8BKW4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zcchc4Q8BKW4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms