Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gpc2Q8BKV1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpc2Q8BKV1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms