Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc9Q8BJN4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc9Q8BJN4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc9Q8BJN4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc9Q8BJN4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc9Q8BJN4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc9Q8BJN4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc9Q8BJN4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc9Q8BJN4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc9Q8BJN4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc9Q8BJN4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc9Q8BJN4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc9Q8BJN4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc9Q8BJN4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc9Q8BJN4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc9Q8BJN4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc9Q8BJN4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc9Q8BJN4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc9Q8BJN4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc9Q8BJN4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc9Q8BJN4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc9Q8BJN4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc9Q8BJN4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms