Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2af1l4Q8BGJ9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms