Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Htatsf1Q8BGC0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Htatsf1Q8BGC0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Htatsf1Q8BGC0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Htatsf1Q8BGC0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Htatsf1Q8BGC0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
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