Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Necab1Q8BG18 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Necab1Q8BG18 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Necab1Q8BG18 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Necab1Q8BG18 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Necab1Q8BG18 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Necab1Q8BG18 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Necab1Q8BG18 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Necab1Q8BG18 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Necab1Q8BG18 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Necab1Q8BG18 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Necab1Q8BG18 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Necab1Q8BG18 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Necab1Q8BG18 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Necab1Q8BG18 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Necab1Q8BG18 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Necab1Q8BG18 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Necab1Q8BG18 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Necab1Q8BG18 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Necab1Q8BG18 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Necab1Q8BG18 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Necab1Q8BG18 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Necab1Q8BG18 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Necab1Q8BG18 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Necab1Q8BG18 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Necab1Q8BG18 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Necab1Q8BG18 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms