Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cul9Q80TT8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Cul9Q80TT8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cul9Q80TT8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Cul9Q80TT8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cul9Q80TT8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cul9Q80TT8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cul9Q80TT8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cul9Q80TT8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cul9Q80TT8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cul9Q80TT8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cul9Q80TT8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cul9Q80TT8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cul9Q80TT8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cul9Q80TT8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cul9Q80TT8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cul9Q80TT8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cul9Q80TT8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Cul9Q80TT8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cul9Q80TT8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cul9Q80TT8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cul9Q80TT8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cul9Q80TT8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cul9Q80TT8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cul9Q80TT8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms