Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf8Q80TJ7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf8Q80TJ7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms