Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg1bQ7TSF1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dsg1bQ7TSF1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1bQ7TSF1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms