Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfp397Q7TNK4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp397Q7TNK4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp397Q7TNK4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms