Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN31

Aggf1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aggf1Q7TN31 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aggf1Q7TN31 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aggf1Q7TN31 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms