Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SyncripQ7TMK9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SyncripQ7TMK9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms