Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ScocQ78YZ6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ScocQ78YZ6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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