Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eci3Q78JN3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eci3Q78JN3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms