Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd3eapQ76KJ5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd3eapQ76KJ5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms