Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2d2bQ6ZWY6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d2bQ6ZWY6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms