Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnih3Q6ZWS4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cnih3Q6ZWS4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnih3Q6ZWS4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnih3Q6ZWS4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnih3Q6ZWS4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnih3Q6ZWS4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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