Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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