Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms