Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BC061212Q6P8K3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BC061212Q6P8K3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms