Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Podnl1Q6P3Y9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms