Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2K6

Ppp4r3a, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3aQ6P2K6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppp4r3aQ6P2K6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp4r3aQ6P2K6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp4r3aQ6P2K6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp4r3aQ6P2K6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp4r3aQ6P2K6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp4r3aQ6P2K6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp4r3aQ6P2K6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp4r3aQ6P2K6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp4r3aQ6P2K6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp4r3aQ6P2K6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp4r3aQ6P2K6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp4r3aQ6P2K6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp4r3aQ6P2K6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms