Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ltv1Q6NSQ7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ltv1Q6NSQ7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltv1Q6NSQ7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltv1Q6NSQ7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltv1Q6NSQ7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltv1Q6NSQ7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltv1Q6NSQ7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltv1Q6NSQ7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltv1Q6NSQ7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltv1Q6NSQ7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltv1Q6NSQ7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltv1Q6NSQ7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltv1Q6NSQ7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltv1Q6NSQ7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltv1Q6NSQ7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltv1Q6NSQ7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ltv1Q6NSQ7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ltv1Q6NSQ7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ltv1Q6NSQ7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ltv1Q6NSQ7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ltv1Q6NSQ7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ltv1Q6NSQ7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ltv1Q6NSQ7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ltv1Q6NSQ7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ltv1Q6NSQ7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ltv1Q6NSQ7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ltv1Q6NSQ7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ltv1Q6NSQ7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ltv1Q6NSQ7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ltv1Q6NSQ7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ltv1Q6NSQ7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ltv1Q6NSQ7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ltv1Q6NSQ7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ltv1Q6NSQ7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ltv1Q6NSQ7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ltv1Q6NSQ7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ltv1Q6NSQ7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ltv1Q6NSQ7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ltv1Q6NSQ7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ltv1Q6NSQ7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ltv1Q6NSQ7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ltv1Q6NSQ7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ltv1Q6NSQ7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ltv1Q6NSQ7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ltv1Q6NSQ7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ltv1Q6NSQ7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ltv1Q6NSQ7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ltv1Q6NSQ7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ltv1Q6NSQ7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ltv1Q6NSQ7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ltv1Q6NSQ7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms